《华西口腔医学杂志》是中文科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊），同时列为中文核心期刊要目总览（北大版）第一版至第十版核心期刊，被中国科学评价研究中心评为RCCSE中国核心学术期刊。目前被国内外收录的数据库如下。   

国外数据库：

美国国家医学图书馆的医学索引（IM）和MEDLINE

美国国家医学图书馆的PubMed Central（PMC）数据库

Scopus数据库

美国《化学文摘》（CA）数据库

美国《乌利希国际期刊指南》（Ulrich PD）

波兰《哥白尼索引》（IC）

日本科学技术信息中心数据库

美国《剑桥科学文摘（自然科学）》（CSA）

世界卫生组织西太平洋地区医学索引（WPRIM）

英国《动物学记录》（ZR, BIOSIS）数据库

美国EBSCO数据库   

国内数据库：

中国学术期刊综合评价数据库

中国核心期刊（遴选）数据库

中文科技期刊数据库

中文生物医学期刊文献/会议论文数据库（CMCC/CMAC）

中国科学引文数据库(CSCD)

中国科技期刊精品数据库

中国科技论文引文数据库（CSTPCD）